Un bon nombre de dossiers sont également retenus dans la catégorie des projets à vocation nationale et régionale : biotechnologies végétales (Auvergne), fruits et légumes (Paca, Rhône Alpes, Languedoc-Roussillon), fibres naturelles (Lorraine, Alsace), pin maritime (Aquitaine), filière équine (Basse-Normandie), viandes et produits carnés (Centre, Est, Ile-de-France), agronutrition en milieu tropical (Réunion), alimentation (Bretagne), énergies non génératrices d’effet de serre (Paca)…
Ces pôles associent entreprises, centres de formation et unités de recherche. Ils bénéficieront d’exonérations fiscales et sociales, de crédits des ministères et de financements des agences publiques de recherche et d’innovation, pour un montant de 1,5 milliard d’euros durant trois ans.